Jorge Zorreguieta está acusado de estar involucrado en el secuestro y desaparición de una funcionaria de un organismo del Ministerio de Agricultura y Ganadería, del que Zorreguieta estuvo encargado entre 1976 y 1983, aunque su nombramiento en el cargo de subsecretario de esa cartera se produjo 15 días después del secuestro.

El juez encargado de la causa aseguró que, hasta su desaparición, la mujer trabajaba en el Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), donde fue dada de baja al día siguiente de su desaparición, por medio de una resolución de la intervención militar, debido a "razones de seguridad", según informa el diario argentino La Nación.